在河南省办理环境工程大气污染防治工程设计专项乙级资质，需要按照以下流程进行：
了解资质标准：
首先，详细阅读并理解河南省住房和城乡建设厅或国家住房和城乡建设部关于环境工程设计专项资质的具体要求，特别是针对大气污染防治工程乙级资质的标准，包括企业条件、人员配置、技术装备、工程业绩等方面的要求。
组建专业团队：
根据资质标准要求，配备相应数量和专业的注册工程师及非注册工程师，涵盖机械、电气（供配电）、结构、环境、暖通空调、自动控制、概预算等多个专业领域。
准备申请材料：
收集并整理企业法人营业执照、公司章程、技术人员的注册书、工作经验明、社会保险缴纳记录、企业基本制度、质量管理手册、已完成工程项目的设计合同、验收报告等相关明材料。
在线申报：
登录河南省住房和城乡建设厅官方网站或全国建筑市场监管公共服务平台，按照指引完成在线资质申请表格的填写，并上传所有必要的电子文档。
提交书面材料：
在线申报完成后，按要求将所有纸质材料装订成册，提交至指定的审批窗口或邮寄至指定地址。
资质审查：
相关审批部门会对提交的申请材料进行审核，必要时会安排现场核查或要求补充材料。
资质公示：
审核通过后，申请企业的基本信息及资质情况会在官方网站上进行公示，公示期一般为10个工作日。
领取资质书：
公示无异议后，企业可前往指定地点领取乙级资质书，或者根据当地规定等待邮寄送达。
后续管理：
获得资质后，企业应按照规定参加年检，保持技术人员配置、企业信用等各项条件符合资质要求，以维持资质的有效性。
注意，以上流程和要求可能随政策调整而变化，具体操作时应以河南省住房和城乡建设厅的最新公告和指南为准。
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